毎年，中学1年生から３年生の3学年を対象に，英語と数学の特別学習を実施していますが，今年も下記のような予定で実施しています。なお，参加者は学校の授業担当者による指名制で，各授業とも10数名程度で構成しています。
なお，どの曜日も前半学習時間を利用して，聖トマス寮中学棟別館の３Ｆの教室が会場です。
| 英語 | 数学 | |
| 中１ | 月・金 | 木 |
| 中２ | 水 | 火・土 |
| 中３ | 土 | 火・木 |
なお，特別学習参加者は定期テストが終了する毎に変更しております。その都度のご家庭への連絡はしておりませんので，是非，ご子息にお問い合わせください。また，この特別学習に際しましては，参加費などは徴収しておりません。